Atsižvelgiant į paciento nusiskundimus ir įtariamą infekcijos vietą, mikrobiologiniam tyrimui gali būti imami įvairūs mėginiai, pavyzdžiui, šlapimas, tepinėliai iš nosies, gerklės, lytinių takų ar kitų vietų, taip pat žaizdų išskyros. Laboratorijoje mėginys pasėjamas į specialias terpes, kuriose, esant tinkamoms sąlygoms, gali augti mikroorganizmai. Nustačius reikšmingą sukėlėją, gali būti atliekamas jo jautrumo antimikrobiniams vaistams tyrimas, padedantis įvertinti, kurie vaistai galėtų būti veiksmingi.
Mikrobiologiniai pasėliai gali būti skiriami įtariant šlapimo takų, kvėpavimo takų, lytinių takų, odos ar minkštųjų audinių infekcijas, taip pat kitais atvejais, kai svarbu nustatyti galimą infekcijos sukėlėją. Tyrimo poreikis ir tinkamiausias mėginio tipas parenkami atsižvelgiant į simptomus bei gydytojo įvertinimą.
Tyrimo rezultatų gavimo laikas priklauso nuo mėginio rūšies ir mikroorganizmų augimo ypatumų. Kai kuriais atvejais rezultatai gaunami per kelias dienas, o tam tikriems mikroorganizmams nustatyti gali prireikti daugiau laiko. Tinkamas mėginio paėmimas ir laikymasis pasiruošimo nurodymų yra svarbūs siekiant patikimų rezultatų.
